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Projetos Científicos e Pesquisadores

Os Projetos de Pesquisa da UNESP que serão atendidos pelo GridUNESP são:

• Definição de Regiões Genômicas Críticas Envolvidas na Progressão, Resposta a Tratamento e Metástase em Tumores Humanos
• Dinâmica de Vórtices em Supercondutores de Alta Temperatura Crítica do Tipo II
• Estudo Mecânico Quântico de Processos Não Radiativos em Moléculas de Interesse Biológico
• Estudo Numérico de Sistemas de Eletrons Fortemente Correlacionados em Baixa Dimensionalidade
• Genoma Estrutural-Rede de Biologia Molecular Estrutural
• Implementação Otimizada de Algoritmos Estocásticos para Alinhamento Múltiplo de Seqüências em Clusters de Arquitetura Beowulf
• Simulações Numéricas de Larga Escala em Física
• Física de Altas Energias e HEP Grid
• UNESP-Gridgene
• Modelagem das Propriedades Elétricas de Cerâmicas Semicondutoras
• Aspectos Termodinâmicos no Processo de Enovelamento de Proteínas
• Modelagem Tridimensional de Dados Geológicos, Fisiográficos, Hidrográficos e Geo-ambientais
• Caracterização Teórica das Propriedades Elétricas e Catalizadoras de Óxidos
• Métodos Analíticos e Numéricos em Engenharia Mecânica
• Análise de Fluxo de Dados: Um Modelo para a Detecção de Ataques em Grids Computacionais e Redes de Alta Velocidade
• Caracterização de novos materiais para uso no desenvolvimento de nanomateriais e materiais de alto valor agregado
• Bioprospecção químico-farmacológica para obtenção de bioprodutos farmacêuticos, cosméticos e agroquímicos

A equipe completa de pesquisadores envolvidos no projeto pode ser encontrada aqui e maiores detalhes sobre cada um dos projetos científicos podem ser encontrados aqui.

Os projetos apresentados envolvem as seguintes instituições distribuídas:

• Instituto de Química, Araraquara
• Faculdade de Ciências, Laboratório de Simulação Molecular, Departamento de Matemática, Bauru
• Faculdade de Ciências, Departamento de Química, Bauru
• Faculdade de Ciências, Departamento de Física, Bauru
• Faculdade de Medicina de Botucatu, Departamento de Urologia, Botucatu
• Faculdade de Engenharia, Departamento de Engenharia Mecânica, Ilha Solteira.
• Instituto de Geociências e Ciências Exatas, Departamento de Física, Rio Claro
• Instituto de Geociências e Ciências Exatas, Departamento de Estatística Matemática Aplicada e Computação, Rio Claro
• Instituto de Geociências e Ciências Exatas, Departamento de Petrologia e Metalogenia, Rio Claro
• Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Departamento de Ciências da Computação e Estatística, São José do Rio Preto
• Instituto de Física Teórica, São Paulo

Cronograma de Execução

O Cronograma de execução do projeto do GridUNESP originalmente proposto à Finep pode ser encontrado aqui.

Organograma

A gerência do projeto é constituída pelas seguintes Coordenações:

Coordenação Científica

• Contato com os grupos de pesquisadores das unidades
• Contato com as iniciativas internacionais de Grid
• Estabelecimento dos objetivos estratégicos do GridUNESP

Coordenação Técnica

• Configuração do hardware
• Implantação e integração dos clusters

Coordenação de TI

• Contato com os pólos de informática das unidades
• Planejamento de rede
• Coordenação dos grupos de TI trabalhando em P&D em Grid
• Treinamento aos pesquisadores na utilização do cluster (submissão de jobs, etc)

Coordenação Administrativa

• Organização de reuniões e workshops
• Licitações e Compras
• Prestações de contas
• Relatórios do projeto

O Organograma do projeto do GridUNESP pode ser encontrado aqui.

Clusters e Distribuição Geográfica

Clusters

Tier 0

• 1 Servidor de Gerenciamento (4 GB RAM, 146 GB disco)
• 128 Nós de Processamento (2 GB RAM, 36 GB disco)
• 3 Servidores de Armazenamento (2 GB RAM, 36 GB disco)
• 6 Unidades de Armazenamento (6 X 4 TB, SCSI U320, Tecnologia RAID 5)
• 1 Switch Gerenciável Nível 2 (24 portas Gigabit RJ45 + 4 Gigabit fibra)
• 4 Switches Não gerenciável, Nível 2 (48 portas Gigabit RJ45)
• 19 Nobreaks (8 tomadas, 3kVA, 220 V)
• 5 Racks (19” de largura X 42 U’s de altura)

Tier 1

• Servidor Gerenciamento/Armazenamento (4 GB RAM, 146 GB)
• 16 Nós de Processamento(2 GB RAM, 36 GB disco)
• 1 Unidade de Armazenamento (4 TB, SCSI U320, Tecnologia RAID 5)
• 1 Switche Nível 2 (24 portas Gigabit RJ45 + 4 portas Gigabit fibra)
• 3 Nobreaks (8 tomadas, 3kVA, 220 V)
• 1 Racks (19” de largura x 42 U’s de altura)

Os esquemas dos racks podem ser vistos aqui.

Distribuição Geográfica

O mapa com a distribuição geográfica da Tier 0 e das Tiers 1 pode ser visto aqui.

Workshops

I Workshop - Bauru

O I Workshop do GridUNESP foi realizado em 24 de maio de 2004 no campus de Bauru. O programa deste workshop e as respectivas apresentações podem ser encontrados aqui.

II Workshop - Reitoria/São Paulo

O II Workshop do GridUNESP foi realizado em 6 de outubro de 2006 na Reitoria da UNESP. O programa do workshop foi:

Horário	Apresentador	Título
09h45	Dr. José Arana Varela	O ProINFRA e a GridUNESP
10h00	Dr. Sérgio F. Novaes	O Projeto GridUNESP: Integrando a Capacidade Computacional da UNESP
10h30	Dr. Antonio D. Rivera	Inovação na Arquitetura para a Computação do Futuro
11h00	Dr. Eduardo M. Gregores	Planejamento para a Implantação do GridUNESP
11h30	Dr. José Roberto Gimenez	Recursos de Conectividade para o GridUNESP
12h00	Discussão

III Workshop - IFT/São Paulo

O III Workshop do GridUNESP será realizado no dia 14 de dezembro de 2007 no Instituto de Física Teórica - IFT/UNESP. O workshop, "GridUNESP: Integração e Oportunidades de Pesquisa", tem por objetivo apresentar o status do projeto e discutir as próximas etapas de sua implementação. Além disto, aproveitaremos esta oportunidade para fazer um levantamento das necessidades de processamento e armazenamento, agora dando ênfase às características das tarefas que serão submetidos ao Grid, ou seja o perfil dos problemas a serem atacados e os softwares que são utilizados pelos diferentes grupos. (Organizadores: Ney Lemke e Aguinaldo Robinson de Souza)

Videoconferência

O Workshop deverá ser transmitido através do EVO: http://evo.caltech.edu/.

Programa do Workshop

• OSG Executive Board Meeting
  • https://twiki.grid.iu.edu/twiki/bin/view/Deployment/20071214AgendaMinutes
  • http://indico.fnal.gov/conferenceDisplay.py?confId=1329

Infra-estrutura para Instalação

Levantamento da Infra-estrutura das Unidades do Interior

O Dr. José Roberto Gimenez, Coordenador de TI do GridUNESP, visitou todas as unidades do interior para levantar a infra-estrutura local para instalação dos clusters Tiers 1. Seu relatório, incluindo fotos dos locais, pode ser encontrado aqui.

Esse é o resumo da presente situação dos sites:

Clusters Secundários: Requerimentos

Maiores detalhes sobre os clusters secundários pode ser obtidas aqui.

Reunião: Site Preparation